Добрый день!
Правильно начать с чтения vmkernel.log серверов и SCSI ошибок.
Поясните, пожалуйста, вы пишите, что пробовали менять версию сетевого драйвера. В то же самое время кусок вашего лога говорит о блочном доступе к СХД через адаптер vmhba64.
Вопрос - что это за адаптер и как NetApp подключен? это FCoE или что?